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杏因其營養(yǎng)成分高、適應(yīng)性強(qiáng)而在世界范圍內(nèi)廣泛栽培，其肉質(zhì)鮮美，有著獨特宜人的香氣，杏核也作為堅果食用。杏的基因組已經(jīng)被測序，轉(zhuǎn)錄組、重測序和表型組的數(shù)據(jù)不斷增加。然而，隨著新信息的出現(xiàn)，這些數(shù)據(jù)有望被整合和傳播。


為了更好地管理不斷添加的新數(shù)據(jù)，同時增加其便利性，作者構(gòu)建了杏基因組和表型組數(shù)據(jù)庫。目前，AprGPD包含3個參考基因組、1692個種質(zhì)、306個基因組重測序數(shù)據(jù)、90個RNA測序數(shù)據(jù)。AprGPD 已經(jīng)實現(xiàn)了一套用戶友好的查詢、分析和可視化工具。作者還對杏的三個基因組的 59 個轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行了詳細(xì)分析。


AprGPD展示了六個模塊，包括品種、種質(zhì)、基因組、變異、產(chǎn)出、工具。AprGPD整合的數(shù)據(jù)將有助于杏的分子育種。

來源：Plant Methods.AprGPD: the apricot genomic and phenotypic database.Chen Chen, Huimin Liu, Ningning Gou, Mengzhen Huang, Wanyu Xu, Xuchun Zhu, Mingyu Yin, Haikun Bai, Lin Wang & Ta-na Wuyun
https://plantmethods.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13007-021-00797-4